直销同城网
健海直销平台
当前位置:健海直销平台 > 健海新闻资讯 > 真菌de novo测序介绍

真菌de novo测序介绍

发布时间:2016-11-18浏览:339次 来源: 网络转载 我要转载

概述

真菌的基因组通常较大且复杂,传统的技术无法满足真菌全基因研究的大数据量需求,新一代高通量测序技术, 以其高通量,高准确率,周期快的特点,为真菌的研究提供强有力的支撑,可用于预测真菌的重要基因和蛋白以了解其功能和可能机制;在研究植物致病性真菌方面,可以鉴定致病真菌与农作物互作及致病的相关基因,并可用于研究与其近缘物种的进化关系,比较基因组研究等;在食用真菌和药用真菌的研究方面,可以用于发现真菌复杂的代谢途径,鉴定其对人有益的代谢产物,比较基因组等;另外还可用于生物*真菌的研究,工业酵母菌的研究等。

技术优势

高性价比:低价获得 50× coverage的全基因组数据,及其组装结果

快速精准:摆脱传统研究方法,从碱基水平获得物种真实信息

研究内容

一、数据处理

1.去除接头污染和低质量数据;

2.产出数据及质控统计;

二、基因组组装及概况(GC-depth 分析,k-mer 分析,NT 库比对)

三、基因组组分分析

1.基因成分;

2.重复序列;

3.真菌非编码 RNA 预测。

四、基因功能分析

1.通用功能注释(默认 KEGG, SwissProt, GO,  可选 Nr,COG);

2.病原真菌致病性研究;

3.病原与宿主互作数据库(PHI)注释;

4.碳水化合物相关酶(CAZy)数据库注释;

5.细胞色素 P450 数据库注释

6..分泌蛋白预测

五、信息挖掘推荐

1.数据注释结果的初级应用;

2.不同类型真菌基因组分析推荐

六、比较基因组

1.结构变异(共线性);

2.基因家族

3.共有基因和特有基因

4.物种进化(基于共有基因和特有基因或基因家族构建系统发育树)

七、定制化信息分析

1.可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。


健海直销好做吗?如何加入健海直销?加入健海直销赚钱吗?健海直销产品怎么买?健海直销奖金制度怎样?

1、凡本网注明“来源:直销同城网”的作品均已申请著作权保护,版权均属于直销同城网,转载请注明出处“本文来源于直销同城网”。违反上述声明者,本网将有权追究其相关法律责任。
2、凡本网注明 “来源:XXX(非直销同城网)” 的作品,均转载自其它媒体,转载 目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。如果有侵犯版权请qq联系我们,( )我们将在24小时之内删除!
上一篇:转录组测序介绍 下一篇:动植物de novo测序介绍
健海文章评论
注:请注意将字数控制在150字以内
为本文评分: 1分 5分 10分
验证码: 换一张
健海最新评论
我想了解健海直销
  • 您的姓名:*
  • 您的手机:
  • 您的QQ号:*
  • 您的地区:
  • 立即提交需求
健海热门视频分享