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单细胞RNA-Seq(转录组测序)

发布时间:2016-11-18浏览:421次 来源: 网络转载 我要转载

概述

单细胞RNA-Seq通过对单个细胞的mRNA进行逆转录和PCR扩增,使用高通量测序手段,对单细胞中mRNA进行基因表达定量、功能富集、代谢通路等分析。它可以解决传统RNA定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,是在单细胞水平研究基因表达强有力的工具,极大地拓展了RNA-Seq的应用范围。

产品优势

极低起始量:单个细胞(10pg total RNA)

高灵敏度:检测到90%以上的基因表达

技术重复性好:基因表达一致性超过90%

应用领域

极微量样品的表达分析(单个细胞)

胚胎早期发育研究

肿瘤细胞异质性研究

免疫细胞群研究

干细胞分化研究

研究内容

一、标准信息分析

原始数据去除接头序列及低质量reads;

测序评估(数据比对统计,reads分布随机性统计等)

差异表达基因分析

GO功能显著性富集分析

Pathway显著性富集分析

主成分分析(5个以上样品)

可变剪切分析

SNP分析

二、定制化信息分析

可结合客户需求,定制信息分析内容


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